曾多次遇到客戶反映部件的BOM結構與CAD裝配結構不一致，常見的原因是手動刪改過部件的BOM結構。通常只有確實需要部件結構與模型結構不一致纔會手動干預，如果需要兩者一致，則應該由Windchill自動管理。模型與部件經過“比較”後仍出現不一致基本可以判定是手動刪改BOM表所引起的。
解決的方法也很簡單，就是先清空現有的BOM結構，然後讓Windchill重新生成一份新的：
1. 首先編輯部件，手動刪除BOM結構，即手動選擇所有的元件，然後右鍵選擇移除，然後會彈出右圖中的對話框，請務必選否，否則將破壞模型的裝配結構！！！
2. 然後編輯裝配模型的關聯關係，斷開其與部件的關聯關係，完成後檢入部件，那麼最新版本的部件將不再與裝配關聯，且部件BOM中無任何元件
3. 再次編輯裝配模型的關聯關係，重新建立與部件的關聯關係，此時部件被自動檢出
4. 在裝配的“結構”選項卡中，選擇工具>與部件結構比較，在彈出的界面中單擊構建多級部件結構，即如下圖所示的圖標
5. 此時所構建的部件結構已與裝配結構一致，檢入部件即可