微軟在Windows Server 2012和Windows Server 2012 R2 Hyper-V中引入了一些新的特性，使得Windows Server 2016 Hyper-V中的新增功能顯得比較少。但是，在最新版本中也有一些引人注目的Hyper-V特性，包括虛擬機隔離、存儲彈性的提升
生產檢查點
檢查點，以前被稱爲快照，在一開始的時候就存在於Hyper-V中。這個功能允許管理員不需要恢復備份就可以將一臺虛擬機（VM）回退到之前的一個時間點。使用檢查點帶來的問題是對應用服務器不太奏效。如果使用不當，Hyper-V檢查點可能回損壞數據庫並且對應用造成嚴重破壞。
生產檢查點也以十分類似的方式運行，除非它們使用Volume Shadow Copy Services。當你創建或者應用一個檢查點的時候，這個過程和創建以及恢復一個備份很相似，這使管理員避免了使用檢查點會發生的各種各樣崩潰問題。生產檢查點在Windows Server 2016 Hyper-V裏默認開啓，但是你也可以在必要時恢復回舊的檢查點模式。
虛擬機隔離
虛擬機隔離背後的基本概念是創建一個虛擬機所有者的結構。因此這個虛擬機不可以被移動到其他的結構去或者在其他結構中運行。隔離的虛擬機被加密以防止非授權訪問VM內容。加密可以通過使用BitLocker來實現。在新版本的Hyper-V中會支持虛擬TPM，它可以允許虛擬機通過BitLocker加密。
存儲彈性
在上一個版本的Hyper-V中，存儲的短暫性失去連接可能會導致一個虛擬機失效。即使管理員可以使用故障轉移技術將一個失效的虛擬機轉移到另一個集羣的節點中去，但這也需要存儲的連通性。而且有的時候故障轉移是致命的。
舉個例子，在Hyper-V部署環境中有一些集羣節點是連接到iSCSI目標的，這些iSCSI目標會在高峯期的時候遭遇到低帶寬和間歇性的連接失效。虛擬機可能會因爲超過一分鐘的連接失效而摧毀掉。
存儲彈×××是設計來檢查虛擬機存儲連接的間歇性中斷，而且在會暫停虛擬機直到存儲連接恢復爲止。不過使用集羣等級的故障轉移技術也是一個方法。
在Windows Server 2012 R2裏，管理員有能力複製文件到虛擬機中——即使沒有網絡連接性存在。複製的過程會在沒有網絡連通性的情況下使用VMBus。在Windows Server 2016裏，PowerShell Direct特性也建立在這個概念上。
Windows Server 2016允許管理員遠程在虛擬機上運行PowerShell cmdlets或者腳本，即使虛擬機沒有網絡連通性。這個過程使用了VMBus的功能和Invoke-Command cmdlet。這意味着要使用VMName參數來替代cmdlet's ComputerName參數。