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基因組生物信息實驗（一）：分析平臺
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1、硬件平臺
Intel® Core™i7-5500U CPU @ 2.40GHz
2、操作系統
Windows 8.1中文版、Ubuntu 16.04
3、分析軟件
ART(2016.06.05版)、QUAST（web版）、Samtools（1.2版）、bowtie2（2.3.5版）、Fastqc（0.11.8版）、SOAPdenovo（2.04版）、Blast（2.2.31+版）、Rstudio（3.5版）、Python（2.7版）、gffcompare（0.10.8版）、gffcompare（0.11.2版）、Augustus（3.3版）、IGV（2.5.x版）
4、數據庫資源
NCBI的genome數據庫：
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome
NCBI的SRA數據庫：
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/sra/
NCBI的PubMed數據庫：
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/
Uniport數據庫：
https://www.uniprot.org
EPD數據庫：
https://epd.epfl.ch//index.php
5、分析軟件的對應鏈接
1、art：http://www.niehs.nih.gov/research/resources/software/biostatistics/art/
2、fastqc：http://www.bioinformatics.babraham.ac.uk/projects/fastqc/
3、QUAST：http://quast.bioinf.spbau.ru
4、gffcompare：http://ccb.jhu.edu/software/stringtie/gffcompare.shtml
5、IGV：http://software.broadinstitute.org/software/igv/
6、bowtie2：https://support.illumina.com/sequencing/sequencing_software/igenome.html
7、blast： ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/
8、augustus： http://bioinf.unigreifswald.de/augustus/binaries/old/augustus-3.3.tar.gz
9、samtools：http://samtools.sourceforge.net