讀懂這一篇，集羣節點不下線

作者 | 聲東  阿里雲售後技術專家

導讀：排查完全陌生的問題、完全不熟悉的系統組件，是售後工程師的一大工作樂趣，當然也是挑戰。今天借這篇文章，跟大家分析一例這樣的問題。排查過程中，需要理解一些自己完全陌生的組件，比如 systemd 和 dbus。但是排查問題的思路和方法基本上還是可以複用了，希望對大家有所幫助。

問題一直在發生

1. I'm NotReady

阿里雲有自己的 Kubernetes 容器集羣產品。隨着 Kubernetes 集羣出貨量的劇增，線上用戶零星的發現，集羣會非常低概率地出現節點 NotReady 情況。

據我們觀察，這個問題差不多每個月就會有一到兩個客戶遇到。在節點 NotReady 之後，集羣 Master 沒有辦法對這個節點做任何控制，比如下發新的 Pod，再比如抓取節點上正在運行 Pod 的實時信息。

2. 需要知道的 Kubernetes 知識

這裏我稍微補充一點 Kubernetes 集羣的基本知識。Kubernetes 集羣的“硬件基礎”，是以單機形態存在的集羣節點。這些節點可以是物理機，也可以是虛擬機。集羣節點分爲 Master 和 Worker 節點。

• Master 節點主要用來負載集羣管控組件，比如調度器和控制器；

• 而 Worker 節點主要用來跑業務。Kubelet 是跑在各個節點上的代理，它負責與管控組件溝通，並按照管控組件的指示，直接管理 Worker 節點。

當集羣節點進入 NotReady 狀態的時候，我們需要做的第一件事情，肯定是檢查運行在節點上的 kubelet 是否正常。在這個問題出現的時候，使用 systemctl 命令查看 kubelet 狀態，發現它作爲 systemd 管理的一個 daemon，是運行正常的。當我們用 journalctl 查看 kubelet 日誌的時候，發現了下邊的錯誤。

3. 什麼是 PLEG

這個報錯很清楚的告訴我們，容器 runtime 是不工作的，且 PLEG 是不健康的。這裏容器 runtime 指的就是 docker daemon，Kubelet 通過直接操作 docker daemon 來控制容器的生命週期。

而這裏的 PLEG，指的是 pod lifecycle event generator。

PLEG 是 kubelet 用來檢查容器 runtime 的健康檢查機制。這件事情本來可以由 kubelet 使用 polling 的方式來做。但是 polling 有其成本上的缺陷，所以 PLEG 應用而生。PLEG 嘗試以一種“中斷”的形式，來實現對容器 runtime 的健康檢查，雖然它實際上同時用了 polling 和“中斷”兩種機制。

基本上看到上邊的報錯，我們可以確認，容器 runtime 出了問題。在有問題的節點上，通過 docker 命令嘗試運行新的容器，命令會沒有響應。這說明上邊的報錯是準確的。

容器 runtime

1. Docker Daemon 調用棧分析

Docker 作爲阿里雲 Kubernetes 集羣使用的容器 runtime，在 1.11 之後，被拆分成了多個組件以適應 OCI 標準。

拆分之後，其包括 docker daemon，containerd，containerd-shim 以及 runC。組件 containerd 負責集羣節點上容器的生命週期管理，並向上爲 docker daemon 提供 gRPC 接口。

在這個問題中，既然 PLEG 認爲容器運行是出了問題，我們需要先從 docker daemon 進程看起。我們可以使用 kill -USR1 <pid> 命令發送 USR1 信號給 docker daemon，而 docker daemon 收到信號之後，會把其所有線程調用棧輸出到文件 /var/run/docker 文件夾裏。

Docker daemon 進程的調用棧相對是比較容易分析的。稍微留意，我們會發現大多數的調用棧都類似下圖中的樣子。<br />通過觀察棧上每個函數的名字，以及函數所在的文件（模塊）名稱，我們可以看到，這個調用棧下半部分，是進程接到 http 請求，做請求路由的過程；而上半部分則進入實際的處理函數。最終處理函數進入等待狀態，等待的是一個 mutex 實例。

到這裏，我們需要稍微看一下 ContainerInspectCurrent 這個函數的實現，而最重要的是，我們能搞明白這個函數的第一個參數，就是 mutex 的指針。使用這個指針搜索整個調用棧文件，我們會找出，所有等在這個 mutex 上邊的線程。

同時，我們可以看到下邊這個線程。

這個線程上，函數 ContainerExecStart 也是在處理具體請求的時候，收到了 mutex 這個參數。但不同的是，ContainerExecStart 並沒有在等待 mutex，而是已經拿到了 mutex 的所有權，並把執行邏輯轉向了 containerd 調用。關於這一點，我們可以使用代碼來驗證。

前邊我們提到過，containerd 向上通過 gRPC 對 docker daemon 提供接口。此調用棧上半部分內容，正是 docker daemon 在通過 gRPC 請求來呼叫 containerd。

2. Containerd 調用棧分析

與輸出 docker daemon 的調用棧類似，我們可以通過 kill -SIGUSR1 <pid> 命令來輸出 containerd 的調用棧。不同的是，這次調用棧會直接輸出到 messages 日誌。

Containerd 作爲一個 gRPC 的服務器，它會在接到 docker daemon 的遠程請求之後，新建一個線程去處理這次請求。關於 gRPC 的細節，我們這裏其實不用關注太多。<br />在這次請求的客戶端調用棧上，可以看到這次調用的核心函數是 Start 一個進程。我們在 containerd 的調用棧裏搜索 Start，Process 以及 process.go 等字段，很容易發現下邊這個線程。

這個線程的核心任務，就是依靠 runC 去創建容器進程。而在容器啓動之後，runC 進程會退出。所以下一步，我們自然而然會想到，runC 是不是有順利完成自己的任務。

查看進程列表，我們會發現，系統中有個別 runC 進程，還在執行，這不是預期內的行爲。容器的啓動跟進程的啓動，耗時應該是差不對的，系統裏有正在運行的 runC 進程，則說明 runC 不能正常啓動容器。

什麼是 Dbus

1. RunC 請求 Dbus

容器 runtime 的 runC 命令，是 libcontainer 的一個簡單的封裝。這個工具可以用來管理單個容器，比如容器創建，或者容器刪除。在上節的最後，我們發現 runC 不能完成創建容器的任務。

我們可以把對應的進程殺掉，然後在命令行用同樣的命令嘗試啓動容器，同時用 strace 追蹤整個過程。

分析發現，runC 停在了向帶有 org.free 字段的 dbus 寫數據的地方。那什麼是 dbus 呢？在 Linux 上，dbus 是一種進程間進行消息通信的機制。

2. 原因並不在 Dbus

我們可以使用 busctl 命令列出系統現有的所有 bus。如下圖，在問題發生的時候，我看到客戶集羣節點 Name 的編號非常大。所以我傾向於認爲，dbus 某些相關的數據結構，比如 Name 耗盡了引起了這個問題。

Dbus 機制的實現，依賴於一個組件叫做 dbus-daemon。如果真的是 dbus 相關數據結構耗盡，那麼重啓這個 daemon，應該是可以解決這個問題。但不幸的是，問題並沒有這麼直接。重啓 dbus-daemon 之後，問題依然存在。

在上邊用 strace 追蹤 runC 的截圖中，我提到了，runC 卡在向帶有 org.free 字段的 bus 寫數據的地方。在 busctl 輸出的 bus 列表裏，顯然帶有這個字段的 bus，都在被 systemd 使用。這時，我們用 systemctl daemon-reexec 來重啓 systemd，問題消失了。

所以基本上我們可以判斷一個方向：問題可能跟 systemd 有關係。

Systemd 是硬骨頭

Systemd 是相當複雜的一個組件，尤其對沒有做過相關開發工作的同學來說，比如我自己。基本上，排查 systemd 的問題，我用到了四個方法：

• （調試級別）日誌
• core dump
• 代碼分析
• 以及 live debugging

其中第一個、第三個和第四個結合起來使用，讓我在經過幾天的鏖戰之後，找到了問題的原因。但是這裏我們先從“沒用”的 core dump 說起。

1. 沒用的 Core Dump

因爲重啓 systemd 解決了問題，而這個問題本身，是 runC 在使用 dbus 和 systemd 通信的時候沒有了響應，所以我們需要驗證的第一件事情，就是 systemd 不是有關鍵線程被鎖住了。

查看 core dump 裏所有線程，只有以下一個線程並沒有被鎖住，它在等待 dbus 事件，以便做出響應。

2. 零散的信息

因爲無計可施，所以只能做各種測試、嘗試。使用 busctl tree 命令，可以輸出所有 bus 上對外暴露的接口。從輸出結果看來，org.freedesktop.systemd1 這個 bus 是不能響應接口查詢請求的。

使用下邊的命令，觀察 org.freedesktop.systemd1 上接受到的所有請求，可以看到，在正常系統裏，有大量 Unit 創建刪除的消息，但是有問題的系統裏，這個 bus 上完全沒有任何消息。

gdbus monitor --system --dest org.freedesktop.systemd1 --object-path /org/freedesktop/systemd1

分析問題發生前後的系統日誌，runC 在重複地跑一個 libcontainer_%d_systemd_test_default.slice 測試，這個測試非常頻繁，但是當問題發生的時候，這個測試就停止了。

所以直覺告訴我，這個問題可能和這個測試有很大的關係。

另外，我使用 systemd-analyze 命令，打開了 systemd 的調試日誌，發現 systemd 有 Operation not supported 的報錯。

根據以上零散的知識，只能做出一個大概的結論：org.freedesktop.systemd1 這個 bus 在經過大量 Unit 創建刪除之後，沒有了響應。<br />而這些頻繁的 Unit 創建刪除測試，是 runC 某一個 checkin 改寫了 UseSystemd 這個函數，而這個函數被用來測試 systemd 的某些功能是否可用。UseSystemd 這個函數在很多地方被調用，比如創建容器、查看容器性能等操作。

3. 代碼分析

這個問題在線上所有 Kubernetes 集羣中，發生的頻率大概是一個月兩例。問題一直在發生，且只能在問題發生之後，通過重啓 systemd 來處理，這風險極大。

我們分別給 systemd 和 runC 社區提交了 bug，但是一個很現實的問題是，他們並沒有像阿里雲這樣的線上環境，他們重現這個問題的概率幾乎是零，所以這個問題沒有辦法指望社區來解決。硬骨頭還得我們自己啃。

在上一節最後，我們看到了問題出現的時候，systemd 會輸出一些 Operation not supported 報錯。這個報錯看起來和問題本身風馬牛不相及，但是直覺告訴我，這或許是離問題最近的一個地方，所以我決定，先搞清楚這個報錯因何而來。

Systemd 代碼量比較大，而報這個錯誤的地方也比較多。通過大量的代碼分析（這裏略去一千字），我發現有幾處比較可疑地方，有了這些可疑的地方，接下來需要做的事情，就是等待。在等待了三週以後，終於有線上集羣再次重現了這個問題。

4. Live Debugging

在徵求客戶同意之後，下載 systemd 調試符號，掛載 gdb 到 systemd 上，在可疑的函數下斷點，continue 繼續執行。經過多次驗證，發現 systemd 最終踩到了 sd_bus_message_seal 這個函數裏的 EOPNOTSUPP 報錯。

這個報錯背後的道理是，systemd 使用了一個變量 cookie，來追蹤自己處理的所有 dbus message。每次在加封一個新消息的時候，systemd 都會先把 cookie 這個值加一，然後再把這個 cookie 值複製給這個新的 message。

我們使用 gdb 打印出 dbus->cookie 這個值，可以很清楚看到，這個值超過了 0xffffffff。所以看起來，這個問題是 systemd 在加封過大量 message 之後，cookie 這個值 32 位溢出，新的消息不能被加封導致的。

另外，在一個正常的系統上，使用 gdb 把 bus->cookie 這個值改到接近 0xffffffff，然後觀察到，問題在 cookie 溢出的時候立刻出現，則證明了我們的結論。

5. 怎麼判斷集羣節點 NotReady 是這個問題導致的

首先我們需要在有問題的節點上安裝 gdb 和 systemd debuginfo，然後用命令 gdb / usr/lib / systemd / systemd 1 把 gdb attach 到 systemd，在函數 sd_bus_send 設置斷點，之後繼續執行。<br />等 systemd 踩到斷點之後，用 p /x bus->cookie 查看對應的 cookie 值，如果此值超過了 0xffffffff，那麼 cookie 就溢出了，則必然導致節點 NotReady 的問題。確認完之後，可以使用 quit 來 detach 調試器。

問題修復

這個問題的修復，並沒有那麼直截了當。原因之一是 systemd 使用了同一個 cookie 變量來兼容 dbus1 和 dbus2。

• 對於 dbus1 來說，cookie 是 32 位的，這個值在經過 systemd 三五個月頻繁創建刪除 Unit 之後，是肯定會溢出的；

• 而 dbus2 的 cookie 是 64 位的，可能到了時間的盡頭它也不會溢出。

另外一個原因是，我們並不能簡單的讓 cookie 折返，來解決溢出問題。因爲這有可能導致 systemd 使用同一個 cookie 來加封不同的消息，這樣的結果將是災難性的。

最終的修復方法是，使用 32 位 cookie 來同樣處理 dbus1 和 dbus2 兩種情形。同時在 cookie 達到 0xfffffff 之後的下一個 cookie 返回 0x80000000，用最高位來標記 cookie 已經處於溢出狀態。檢查到 cookie 處於這種狀態時，我們需要檢查是否下一個 cookie 正在被其他 message 使用，來避免 cookie 衝突。

後記

這個問題根本原因肯定在 systemd，但是 runC 的函數 UseSystemd 使用不那麼美麗的方法，去測試 systemd 的功能，這個函數在整個容器生命週期管理過程中，被頻繁地觸發，讓這個低概率問題的發生成爲了可能。systemd 的修復已經被紅帽接受，預期不久的將來，我們可以通過升級 systemd，從根本上解決這個問題。

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