1、構建SessionFactory
這是一個典型的Hibernate啓動過程的例子，在一行代碼中，使用自動的配置文件偵測：
SessionFactory sessionFactory = new Confiruration()
.configure()
.buildSessionFactory();Hibernate怎麼知道配置文件放置的位置，以及要加載哪個配置文件呢？
可以把Configuration當作Hibernate配置文件（或者屬性文件）的一個對象表示法。
調用new Configuration()時，Hibernate在classpath的根目錄下搜索名爲hibernate.properties的文件。如果找到了，所有hibernate.*屬性都會被加載並添加到Configuration對象。
調用configure()時，HIbernate在classpath的根目錄下搜索名爲hibernate.cfg.xml的文件，如果無法找到就會拋出一個異常。當然，如果你沒有這個配置文件，就不一定要調用這個方法。如果XML配置文件中的設置與較早設置的屬性完全相同，XML設置就覆蓋前面的設置。
hibernate.properties配置文件的位置始終在classpath的根目錄中，處在任何包之外。如果要使用一個不同的文件，或者要Hibernate在classpath的子目錄中查找XML配置文件，就必須把路徑當作configure()方法的一個實參進行傳遞：
SessionFactory sessionFactory = new Configuration()
.configure("/persistence/auction.cfg.xml")
.buildSessionFactory();最後，在創建SessionFactory之前，你始終可以在Configuration對象中編程式的設置額外的配置選項或者映射文件位置：
SessionFactory sessionFactory = new Configuration()
.configure("/persistence/auction.cfg.xml")
.setProperty(Environment.DEFAULT_SCHEMA, "CAVEATEMPTPR")
.addResource("aucton/CreditCard.hbm.xml")
.buildSessionFactory();許多配置源在這裏得到應用：首先讀取classpath中的Hibernate.properties文件（如果有的話）。接下來，添加來自/persistence/auction.cfg.xml的所有設置，並覆蓋以前應用的任何設置。最後，通過編程設置另一個配置屬性（默認的數據庫Schema名稱），並且添加另一個HIbernate XML映射元數據文件到配置中。
當然，可以通過編程設置所有選項，或者在不同的XML配置文件之間切換，得到不同的部署數據庫。對於如何配置和部署Hibernate,實際上並沒有限制;最後，只需要從一個準備好的配置中創建SessionFactory。
在大部分Hibernate應用程序中，SessionFactory應該在應用程序初始化期間被實例化一次。然後單獨的實例應該爲特定程序中的所有代碼所用，任何Session都應該用這個單獨的SessionFactory來創建。SessionFactory是線程安全的，且能夠被共享；Session是個單線程的對象。
2、數據庫連接
可以提供自己的連接嗎？實現org.hibernate.connection.ConnnectionProvider接口，用hibernate.connection.provider_class配置選項命名你的實現。現在，如果Hibernate需要數據庫連接，它將依賴於你定製的提供程序（provider）。
3、使用Hibernate EntityManager
Hibernate EntityManager是圍繞提供JPA編程接口的Hibernate Core的一個包裝，支持JPA實體實例的生命週期，並允許你用標準的Java Persistence查詢語言編寫查詢。
JPA規範也定義編程接口、持久化對象的生命週期規則和查詢特性。JPA這部分的Hibernate實現可被用作Hibernate EntityManager，這是另一個可以堆在Hibernate Core頂部的可選模塊。當需要簡單的Hibernate接口或者甚至需要JDBC連接時，可以退回。Hibernate原生的特性在各個方面都是JPA持久化的一個超集。（簡單的事實就是，Hibernate EntityManager是對提供JPA兼容性的Hibernate Core的一個小包裝。）
使用標準化的接口和標準化的查詢語言有個好處：可以使用任何EJB 3.0兼容應用程序服務器執行JPA兼容的持久層。或者，可以在簡單的Java中任何特定的標準運行時環境之外使用JPA（這是Hibernate Core可以被用在任何地方的真正含義）。
Hibernate Annotations應該與Hibernate EntityManager結合考慮。如果你針對JPA接口使用JPA編寫應用程序代碼，而沒有用JPA註解創建大部分映射，這是不正常的。
Hibernate也是JBoss應用程序服務器（JBoss AS）的一部分，是J2EE 1.4和Java EE 5.0的一個實現。Hibernate Core、Hibernate Annotations和Hibernate EntityManager結合起來，形成了這個應用服務器的持久話引擎。因此，可以獨立使用每件東西，也可以在應用服務器內部使用並享有所有EJB 3.0的益處，例如會話bean、消息驅動的bean和其他的Java EE服務。
如你所見，原生的Hibernate特性實現了規範的重要部分，或者是必要時提供額外功能的自然的供應商擴展。
有個簡單的技巧，可以立即知道正在看的代碼是JPA還是原生的Hibernate。如果只看見有javax.persistence.*導入，就是正處在規範內工作；如果也導入org.hibernate.*，就是正在使用原生的Hibernate功能。
SessionFactory在Hiibernate應用程序中表示一個特定的邏輯數據存儲配置。EntityManager Factory在JPA應用程序中扮演這同樣的角色，你用配置文件或者在應用程序代碼中配置EntityManager Factory（EMF），就像配置SessionFactory一樣。EMF的配置，與一組映射元數據（通常是被註解的類）一起，被稱作持久化單元（persistence unit）
這些是Java Persistence中主要的編程接口：
javax.persistence.Persistence——給EntityManagerFactory的創建提供一種靜態方法的一個啓動類
javax.persistence.EntityManagerFactory——等同於Hibernate SessionFactory。這個運行時對象表示一個特定的持久化單元。它是線程安全的，通常被當作一個單例（singleton）處理，並給EntityManager實例的創建提供方法。
javax.persistence.EntityManager——等同於Hibernate Session。這個單線程、非共享的對象表示數據訪問的一個特定工作單元。它提供方法去管理實體實例的生命週期並創建Query實例。
javax.persistence.Query——等同於Hibernate Query。一個對象是一種特定的JPA查詢語言或者原生的SQL查詢表示法，它允許參數的安全綁定，並給查詢的執行提供個總各樣的方法。
javax.persistence.EntityTransaction——等同於Hibernate Transaction，在Java SE環境中用於RESOURCE_LOCAL事務的劃分。在Java EE中，依賴JTA標準的javax.transaction.UserTransaction接口進行編程式的事務劃分。
4、如何使用帶有Hibernate的幾個數據庫
如果要使用幾個數據庫，就創建幾個配置文件，每個數據庫都分配它自己的SessionFactory，並且從不同的Configuration對象中構建幾個SessionFactory實例。每個Session都從任何SessionFactory中打開，在JNDI中查找託管數據源。現在協調這些資源就是事務和資源管理器的責任了——Hibernate只在這些數據庫連接上執行SQL語句。事務範圍用JTA進行編程式地設置，或者由包含EJB的容器和一個聲明的集合來處理。