[最新更新，於2012-03-10]
對於pdf文件是文字編碼方式(非圖片)，可以用用下面的方式生成mobi格式，且可以修改！！
通過mobipocket creator把pdf轉爲prc，中間不設置任何信息，直接build就行！
然後在生成的文件夾裏找到 xxx.html，也就是說在生成prc文件的過程中這個工具還生成了相應的html！html格式就很好修改了。用Editplus修改目錄顯示，直接把html拖到KindlePreviewer中可以通過其內置的Kindlegen把html轉爲mobi，如下圖所示：
原文
轉自 http://kindleren.com/thread-235-1-1.html
[注意] 通過這種方法轉換之後的格式爲prc，好像是plam上支持的一種格式，又貌似和mobi類似。mobi和prc格式的區別是什麼？目前不清楚。但kindle 4 可以識別prc。並且通過這種方式轉換後的文件支持目錄！！！很方便。畢竟有很多電子書比較完整的都是pdf。
kindle支持直接閱讀txt和pdf，但txt檔本身沒有目錄，而kindle既不支援pdf自帶的目錄，也不能對pdf檔進行語音朗讀和即指即譯。所以爲了實現目錄跳轉、語音朗讀、即指即譯三大功能，必須將它們轉換成kindle支援較好的mobi格式。
1.預處理
首先把txt檔轉成html格式，最簡單的方法是用word打開，然後另存爲.html，接下來選擇“格式”-“樣式和格式”，對需要加註標題的地方加上標題格式，三種標題格式適用於不同的目錄層級，相當於篇、章、節之間的關係，全部加註完後存檔退出。
pdf不用做事先處理，事先看一下有幾級目錄就好.
2.準備軟件
下載做書軟體mobipocket creator，http://www.orsoon.com/soft/5858.html，安裝時注意選擇功能更全的publisher edition，爲了在PC上看書的實際效果，推薦把mobipocket reader也裝上。
運行mobipocket creator，選擇你要轉換的文件類型，本類是轉換pdf的，所以直接選擇了pdf.
3.開始轉換了。
在左側Cover Image選擇一張圖片做封面，然後點擊update
在Table of Contents部分，點擊Add a Table of Contents，第一欄填目錄名稱，通常叫“目錄”就好，下面的三欄是目錄生成規則，你設定了幾層目錄就填幾項，比如只有一層目錄就在Tag Name那裏填寫h1，兩層就填h1，h2...然後點擊update。
接下來到Metadata部分，填寫書名、作者名、分類等資訊，如果希望在DX中顯示中文書名作者名就用中文，如果希望能用搜索書名和作者的功能就用英文或拼音。完成後點擊update。
這時設定全部完成，點擊上方功能表欄裏的Build圖示，再點擊Build。
最後等了大概10分鐘終於轉換完成。可能是以爲我的pdf文件太大了（150M）。
生成的檔默認位置在我的文檔——“我的發佈”目錄下的子目錄裏，尾碼爲prc，把prc檔拷入kindle裏Documents目錄下，就可以閱讀了。進入書籍後按Menu—Table of Contents可以看到目錄，如果是英文書的話語音朗讀、即指即譯也沒有問題了。
如果這都還找不到生成的最終目錄也可以勾選“Open folder containing eBook”,然後點擊"ok"
這樣就找到你剛纔生成的文件了。把它靠近你的kindle的documents文件夾下。
好累啊。終於好了。。親測可以用。。