1.在需要混淆的工程目錄下(package/apps/下的工程)添加proguard.flags文件，該文件即爲網絡傳說中的proguard.cfg，只是命名不一樣而已，然後再Android.mk中添加如下兩句：
LOCAL_PROGUARD_ENABLED := full
LOCAL_PROGUARD_FLAG_FILES := proguard.flags
上面的full 也可以是custom，如果不寫這句，那還得添加如下一句：
TARGET_BUILD_VARIANT := user或者TARGET_BUILD_VARIANT := userdebug
這樣後在工程目錄下執行mm便可以看到在out目錄下生成了形如proguard.classes.jar的東東，這就說明已在編譯中啓動了proguard
但反編譯一看，並未出現網絡雲說的abcd替代符號，其實代碼並未真正混淆：
android在編譯時默認關閉了混淆選項，有去研究build/core目錄的同志會發現這裏也有個proguard.flags文件，其實在proguard的過程中，編譯器會調用包括本地目錄下和系統定義了的多個proguard.flags文件，而在這個文件中混淆的選項被禁止了，故而編譯出來的apk仍未混淆。因此將如下句子註釋掉便可實現真正的混淆編譯：
# Don't obfuscate. We only need dead code striping.
-dontobfuscate（將該句加個#號註釋掉）
好奇的同志還可以繼續看看，爲什麼TARGET_BUILD_VARIANT := user和LOCAL_PROGUARD_ENABLED := full二選一即可，詳見build/core/package.mk:
LOCAL_PROGUARD_ENABLED:=$(strip $(LOCAL_PROGUARD_ENABLED))
ifndef LOCAL_PROGUARD_ENABLED
ifneq ($(filter user userdebug, $(TARGET_BUILD_VARIANT)),)
# turn on Proguard by default for user & userdebug build
LOCAL_PROGUARD_ENABLED :=full
endif
endif
ifeq ($(LOCAL_PROGUARD_ENABLED),disabled)
# the package explicitly request to disable proguard.
LOCAL_PROGUARD_ENABLED :=
endif
proguard_options_file :=
ifneq ($(LOCAL_PROGUARD_ENABLED),custom)
ifneq ($(all_resources),)
proguard_options_file := $(package_expected_intermediates_COMMON)/proguard_options
endif # all_resources
endif # !custom
LOCAL_PROGUARD_FLAGS := $(addprefix -include ,$(proguard_options_file)) $(LOCAL_PROGUARD_FLAGS)
具體我就不解釋了，大家自己理解吧哈
原文地址：http://www.eoeandroid.com/thread-151712-1-1.html