使用教程參考:
https://sites.google.com/view/ml-basics/dealing-with-molecules
1、安裝需要創立單獨的python虛擬環境,前提需要提前安裝好conda,可以後續方便jupter notebook使用
直接 :conda create -c rdkit -n my-rdkit-env rdkit
激活:To activate this environment, use
#
# $ conda activate my-rdkit-env
#
# To deactivate an active environment, use
#
# $ conda deactivate
2、也可以使用ide pycharm,需要設置用剛conda創建的環境
需要進入pycharm設置裏在ide調用的python環境選擇剛傳教的虛擬環境裏的python即可
,設置好就可以直接ide用
from rdkit import Chem
from rdkit.Chem import Draw
mo = Chem.MolFromSmiles('CCCC')
# print(mol)
Draw.MolToFile(mo,"mol.png")