rdkit 安裝使用

使用教程參考:
https://sites.google.com/view/ml-basics/dealing-with-molecules

1、安裝需要創立單獨的python虛擬環境,前提需要提前安裝好conda,可以後續方便jupter notebook使用

直接 :conda create -c rdkit -n my-rdkit-env rdkit


激活:To activate this environment, use
#
#     $ conda activate my-rdkit-env
#
# To deactivate an active environment, use
#
#     $ conda deactivate


2、也可以使用ide pycharm,需要設置用剛conda創建的環境

需要進入pycharm設置裏在ide調用的python環境選擇剛傳教的虛擬環境裏的python即可
,設置好就可以直接ide用
from rdkit import Chem
from rdkit.Chem import Draw

mo = Chem.MolFromSmiles('CCCC')
# print(mol)
Draw.MolToFile(mo,"mol.png")

在這裏插入圖片描述

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