原创 Liquid/Solid Surface-02
目錄Liquid/Solid Surface-02Liquid ModelingModeling in MoltemplateRelaxation in LammpsWall ModelingHybrid ProcessNi-Ni
2020-06-30 03:55:54
原创 Liquid/Solid Surface-01
目錄Liquid/Solid Surface-01Some Slip ModelPE/AuPE/micaOscillatory Couette flowsSome United-Atom PE Force FieldDetails
2020-06-25 04:22:18
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原创 Python實現標準.xyz文件導出
P實現內容 指定步數下的xyz文件 xyz文件格式要求 我是爲了求RDF和鍵角分佈用到的這個xyz文件，當然應該也會有其他的用處，代碼新手所寫，不夠精煉，各位大佬見諒。 所需文件 軌跡文件，Python # -*- coding:
2020-06-20 01:42:29
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原创 金屬和聚合物的層狀模型
玩爛了的三層結構 金屬：fixed atoms------thermostat atoms------newtonian atoms 聚合物：fixed atoms------thermal quench------free la
2020-06-20 01:42:28
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原创 菜雞論文模仿03（滑動摩擦）：幫我檢查一下錯誤唄！！！！！！！
1Gpa下1m/s的滑動摩擦 加載過程中，我的F控溫和F不控溫狀態下，溫度都能達到一個平衡值，但是一到滑動就會出現EF，CD層溫度下降的趨勢，而且也不能最終平衡到某一溫度附近，不知道是我的代碼原因，還是速度太小？ 代碼需要實現的功
2020-06-20 00:22:27
原创 moltemplate導出模型密度控制2.0
模型 這是我用moltemplate做出來的一個聚合度爲50的PE鏈，共有72條，盒子體積64x64x350，ppf邊界。初始結構雖然經過最小化，但是由於間距很小，在lammps中的弛豫過程需要很長的時間甚至會出錯。 解決方案
2020-06-20 00:22:27
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原创 2-bead polymer built by moltemplate_forcefield.lt（example file）
ForceField{ }
2020-06-19 22:56:27
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原创 置頂必看！！
我寫博客的目的 去年年底開始接觸MD，期間走了很多的彎路，調研了很多的軟件，也都嘗試使用過，但最後都不了了之。三月初的時候還告訴導師不想做MD了，因爲感覺自己的處境很封閉，沒有任何學習資料，連最一開始的第一步都很困難，腦子裏連MD
2020-06-19 22:56:27
原创 Lammps基礎命令（2020.3.26.01已更新）
我的辣雞命令們聲明常用命令fix addforcereal的force單位write_restart ,read_restartmove linearreal的velocity單位How to chunk（未完成）compute
2020-06-19 22:56:27
原创 給下一屆-分子動力學相關
目錄給下一屆-分子動力學相關系統選擇Win和Linux軟件安裝LAMMPS安裝Python](https://www.python.org/)及[Anaconda安裝Moltemplate安裝（粗粒化建模）（目前在用）[Mater
2020-06-19 22:56:27
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原创 菜雞論文模仿01（結構優化）：Identifying the Mechanisms of Polymer Friction through Molecular Dynamics Simulation
模仿 MD最好的入門方式就是模仿！！！！！ 找一篇難度適中的，軟件，研究點都比較貼近自己方向的論文進行模仿。作爲初學的我很幸運找到了這篇論文，在模仿過程中也逐漸的掌握了lammps的相關命令，如果大家也覺得適合的話，也可以進行模仿
2020-06-19 22:56:27
原创 反思02
時間步長與運行步數 之前的我的運行時間過短，基本都是0.3 x 150000的組合。對EF加載（我目前改爲15MPa，作爲練習的話建議先1Gpa運行看看與論文對比）。運行時間如果過短，可能會出現EF層“壓”不住CD的現象，這是正常
2020-06-19 22:56:27
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原创 Windows下Ubuntu子系統安裝
應用商店安裝（企業版，專業版已有） Windows LTSC、LTSB、Server 安裝 Windows Store 應用商店 我下載的四個文件，在文件夾內Powershell命令欄輸入命令即可。 Add-AppxPackage
2020-06-19 22:56:27
原创 分子動力學入門
所用系統 Windows 10 企業版 現用軟件 Materials studio 7.0（商用）鏈接: link Lammps（免費開源）鏈接: link Ovito（可視化）鏈接: link 其餘軟件 由於首先接觸的是粗粒
2020-06-19 22:56:27
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