Ubuntu1804源代碼編譯安裝PBSPro

官方的安裝包貌似只支持PRM的發行版,如RedHat和Suse,本文在Ubuntu 1804下,用源代碼方式編譯安裝,原始編譯安裝文檔是在1604下的,本文使用1804,所以有些更正。

1. 環境:Ubuntu 1804,X86_64版。

2. 安裝編譯所需要的環境:

sudo apt-get install gcc make libtool libhwloc-dev libx11-dev libxt-dev libedit-dev libical-dev ncurses-dev perl  postgresql-server-dev-all python-dev tcl-dev tk-dev swig  libexpat-dev libssl-dev libxext-dev libxft-dev autoconf  automake

3. 安裝運行所需要的環境:

sudo apt-get install expat libedit2 postgresql python sendmail-bin tcl tk

4. 安裝文本編輯器,用於編輯配置文件,如vi,emacs等,可以根據自己喜好。

5. 安裝libical1a庫,由於Ubuntu1804上缺省使用的是libical的版本3,會造成編譯失敗,所以首先要卸載已經安裝的libical的版本3。

sudo apt-get remove libical-dev libical

6. 下載libical1a和它的dev庫。

wget http://kr.archive.ubuntu.com/ubuntu/pool/main/libi/libical/libical1a_1.0.1-0ubuntu2_amd64.deb

wget http://kr.archive.ubuntu.com/ubuntu/pool/main/libi/libical/libical-dev_1.0.1-0ubuntu2_amd64.deb

7. 安裝libical1a和dev庫。

sudo dpkg --install libical1a_1.0.1-0ubuntu2_amd64.deb 

sudo dpkg --install libical-dev_1.0.1-0ubuntu2_amd64.deb 

8. 在github.com打包下載或使用git clone。

git clone https://github.com/PBSPro/pbspro.git

9. 進入源代碼目錄,執行配置、編譯和安裝,使用安裝目錄:/opt/pbs

./autogen.sh

./configure --prefix=/opt/pbs

make

sudo make install

10. 運行安裝後配置程序,產生配置文件:

udo /opt/pbs/libexec/pbs_postinstall

11. 編輯和配置/etc/pbs.conf,如果要單機運行作業,可以將參數PBS_START_MOM設爲1

12. 修改文件屬性,增加SUID

sudo chmod 4755 /opt/pbs/sbin/pbs_iff /opt/pbs/sbin/pbs_rcp

13. 啓動PBS服務

sudo /etc/init.d/pbs start

14. 建立缺省作業隊列,需要使用root用戶。

sudo su -

. /etc/profile.d/pbs.sh

qmgr

Qmgr: set queue batch queue_type = Execution
Qmgr: set queue batch enabled = True
Qmgr: set queue batch started = True
Qmgr: set server default_queue = batch

15. 查看PBS運行情況,如:

xxin@xxin-ThinkPad-W550s:~$ qstat  -B
Server             Max   Tot   Que   Run   Hld   Wat   Trn   Ext Status
---------------- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- -----------
xxin-ThinkPad-W5     0     0     0     0     0     0     0     0 Active    



xxin@xxin-ThinkPad-W550s:~$ pbsnodes -a
xxin-ThinkPad-W550s
     Mom = xxin-thinkpad-w550s
     ntype = PBS
     state = free
     pcpus = 4
     resources_available.arch = linux
     resources_available.host = xxin-thinkpad-w550s
     resources_available.mem = 16118640kb
     resources_available.ncpus = 4
     resources_available.vnode = xxin-ThinkPad-W550s
     resources_assigned.accelerator_memory = 0kb
     resources_assigned.hbmem = 0kb
     resources_assigned.mem = 0kb
     resources_assigned.naccelerators = 0
     resources_assigned.ncpus = 0
     resources_assigned.vmem = 0kb
     resv_enable = True
     sharing = default_shared
     last_state_change_time = Sun Jul 22 08:08:29 2018

16. 提交測試作業,並查看:

xxin@xxin-ThinkPad-W550s:~$ echo "sleep 222" | qsub
4.xxin-ThinkPad-W550s
xxin@xxin-ThinkPad-W550s:~$ qstat -a

xxin-ThinkPad-W550s: 
                                                            Req'd  Req'd   Elap
Job ID          Username Queue    Jobname    SessID NDS TSK Memory Time  S Time
--------------- -------- -------- ---------- ------ --- --- ------ ----- - -----
4.xxin-ThinkPad xxin     batch    STDIN       12148   1   1    --    --  R 00:00

 

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