1， 事務處理
innodb 支持事務功能，myisam 不支持。
Myisam 的執行速度更快，性能更好。
2，select ,update ,insert ,delete 操作
MyISAM：如果執行大量的SELECT，MyISAM是更好的選擇
InnoDB：如果你的數據執行大量的INSERT或UPDATE，出於性能方面的考慮，應該使用InnoDB表
3，鎖機制不同
InnoDB 爲行級鎖，myisam 爲表級鎖。
注意：當數據庫無法確定，所找的行時，也會變爲鎖定整個表。
如： update table set num = 10 where username like "%test%";
4，查詢表的行數不同
MyISAM：select count(*) from table,MyISAM只要簡單的讀出保存好的行數，注意的是，當count(*)語句包含 where條件時，兩種表的操作是一樣的
InnoDB ： InnoDB 中不保存表的具體行數，也就是說，執行select count(*) from table時，InnoDB要掃描一遍整個表來計算有多少行
5，物理結構不同
MyISAM ：每個MyISAM在磁盤上存儲成三個文件。第一個文件的名字以表的名字開始，擴展名指出文件類型。
.frm文件存儲表定義。
數據文件的擴展名爲.MYD (MYData)。
索引文件的擴展名是.MYI (MYIndex)
InnoDB：基於磁盤的資源是InnoDB表空間數據文件和它的日誌文件，InnoDB 表的大小隻受限於操作系統文件的大小，一般爲 2GB
6，anto_increment 機制不同
更好和更快的auto_increment處理
其他：爲什麼MyISAM會比Innodb 的查詢速度快。
INNODB在做SELECT的時候，要維護的東西比MYISAM引擎多很多；
1）數據塊，INNODB要緩存，MYISAM只緩存索引塊， 這中間還有換進換出的減少；
2）innodb尋址要映射到塊，再到行，MYISAM 記錄的直接是文件的OFFSET，定位比INNODB要快
3）INNODB還需要維護MVCC一致；雖然你的場景沒有，但他還是需要去檢查和維護
MVCC ( Multi-Version Concurrency Control )多版本併發控制
InnoDB：通過爲每一行記錄添加兩個額外的隱藏的值來實現MVCC，這兩個值一個記錄這行數據何時被創建，另外一個記錄這行數據何時過期（或者被刪除）。但是InnoDB並不存儲這些事件發生時的實際時間，相反它只存儲這些事件發生時的系統版本號。這是一個隨着事務的創建而不斷增長的數字。每個事務在事務開始時會記錄它自己的系統版本號。每個查詢必須去檢查每行數據的版本號與事務的版本號是否相同。讓我們來看看當隔離級別是REPEATABLE READ時這種策略是如何應用到特定的操作的：
SELECT InnoDB必須每行數據來保證它符合兩個條件：
1、InnoDB必須找到一個行的版本，它至少要和事務的版本一樣老(也即它的版本號不大於事務的版本號)。這保證了不管是事務開始之前，或者事務創建時，或者修改了這行數據的時候，這行數據是存在的。
2、這行數據的刪除版本必須是未定義的或者比事務版本要大。這可以保證在事務開始之前這行數據沒有被刪除。