問題描述:
輸入m個長度均爲n的DNA序列,求一個DNA序列,到所有序列的總Hamming距離儘量 小。兩個等長字符串的Hamming距離等於字符不同的位置個數,例如,ACGT和GCGA的 Hamming距離爲2(左數第1, 4個字符不同)。
輸入整數m和n(4≤m≤50, 4≤n≤1000),以及m個長度爲n的DNA序列(只包含字母 A,C,G,T),輸出到m個序列的Hamming距離和最小的DNA序列和對應的距離。如有多 解,要求爲字典序最小的解。例如,對於下面5個DNA序列,最優解爲TAAGATAC。
TATGATAC
TAAGCTAC
AAAGATCC
TGAGATAC
TAAGATGT
解決方案:
每列字母出現最多的且字典序相對較小的爲最優解該列字母
#include<stdio.h>
#include<string.h>
int main(){
int m,n;
char p[50][1000],b[1000];
int na,nt,nc,ng,i,j;
printf("請輸入m,n:");
scanf("%d%d",&m,&n); //m爲行n爲列
printf("輸入相應的DNA序列\n");
for(i=0;i<m;i++) //可以按回車依次輸入下一行DNA序列
scanf("%s",&p[i]);
printf("\n");
for(i=0;i<n;i++){
na=0,nt=0,nc=0,ng=0;
for(j=0;j<m;j++){
switch(p[j][i]){
case 'A':
na+=1;
break;
case 'C':
nc+=1;
break;
case 'G':
ng+=1;
break;
case 'T':
nt+=1;
break;
}
}
if(na>=nc&&na>=nt&&na>=ng) b[i]='A';
if(nc>=na&&nc>=nt&&nc>=ng) b[i]='C';
if(ng>=na&&ng>=nc&&ng>=nt) b[i]='G';
if(nt>=na&&nt>=nc&&nt>=ng) b[i]='T';
}
for(i=0;i<n;i++){
printf("%c",b[i]);
}
return 0;
}