ncbi和ensembl上的序列下載

根據已有的基因ID,需要從ncbi和ensembl上下載對應序列。使用語言:python3

從ncbi上下載序列的話,python有一個對應的包,好像是ncbi官方支持的,就叫biopython,省去了去ncbi裏找API。
但是ensembl似乎沒有支持的包,所以只能通過官方的API接口,叫rest,裏面提供了各式各樣的接口服務。(有關exon的信息在lookup的接口裏)。

(另注:不知什麼原因,代碼最好在上午10點之前運行,這樣就不會有問題;其他時間均會有問題。哭了)

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