最終我還是找到了最合理的解決方法。
實際上VS提供分文件目錄管理，只是我們選擇的模式不同。應該選擇“Show All Files”模式。即可自由建立文件層了。。。我實在是太菜鳥了
詳情，請看我另一篇日誌：http://qimo601.iteye.com/admin/blogs/1059299
-----------------------------錯誤的總結，留着提醒他人吧----------------------------
在java和C#的一些項目中，文件的管理是很方便的。但在VS中的VC項目，貌似很難對文件進行分目錄管理。
這是我在網上搜到唯一方法。。 不知道對於VS中的C++還有沒有別的好方法管理文件。
大家可以給我留言告訴我一聲。
如何把項目中的文件分類存放？
當我們往項目中添加新類時，它會把源文件放在Source Files下，頭文件放在Header Files下。當項目中文件很多時，管理不便，最好添加新節點，把文件分類放置。
右擊項目節點樹的根節點，選擇“New Filter...”,在彈出的對話框中填入新節點名，則新節點就建立了，用鼠標節點樹中的文件拖入新節點，就可以把文件分類了。
以上分類只是在項目的節點樹中分類，它不影響文件在磁盤上的位置，所有.cpp文件和.h文件仍在項目的根目錄下，最好文件本身也能分類存放在不同文件夾中。
主要有以下幾步：
1：在Windows下，用“新建文件夾”在項目的根目錄下建立子文件夾，如在test項目中建立src/qt/point2d.h (point2d.h文件直接拖進來):
2：在VS界面中，用“New Filter”在test項目的根目錄下新建過濾器，建立同樣的目錄src/qt/point2d.h
3：在VS中單擊point2d.h文件，修改它文件屬性。如：
將 Relative Paht: .\point2d.h
改爲Relative Paht: .\src\qt\point2d.h
重新打開方案的時候Full Path 屬性就會自動修改成對應的路徑。
4：然後在引入頭文件的main.cpp中修改引入路徑(此時main.cpp在項目的根目錄下)改爲：
#include "src\qt\point2d.h"或者#include ".\src\qt\point2d.h"
後續發現總結：
1：按照如上步驟，先建立物理文件夾，然後在建立對應的同名filter之後，VS的環境就發生了變化，再在項目下新建文件層次的時候，就沒add new filter功能了，而是add new folder。
2：要是在已經建立的文件夾下直接添加.cpp或.h文件會報 "Cannot access data for the desired file since it is in a zombie state." 錯誤，刷新一下文件目錄，就會出現新建的文件，但是上面會有個紅色標誌。
此時可以省略上面的第三步驟（3：在VS中單擊point2d.h文件，修改它文件屬性。）默認相對路徑已經自動填寫成功
解決方法是：將新建的.cpp或.h文件拖回根目錄，然後右擊該文件，選擇include in project ，再拖回原先所在目錄，就識別爲正常程序文件了。
