和大多數數據庫不同，MySQL中有一個存儲引擎的概念，對於不同的存儲需求可以選擇最優的存儲引擎。如下是MySQL種常見的幾種引擎以及其特性。
其中MyISAM和InnoDB是我們最最常用的兩個存儲引擎，下面主要將對比這兩種引擎的特點，以及分析在不同的需求下如何選擇合適的引擎。
MyISAM
MyISAM是MySQL默認的數據庫引擎，它不支持事務、不支持外鍵，優點是訪問速度比較快，因爲使用表級鎖所以不存在死鎖（後面會講），但是一個重要缺陷就是不能在表損壞後恢復數據。所以對於事務完整性要求或者以SELECT、INSERT爲主要需求的應用，MyISAM是最好的選擇。
每一個MyISAM在磁盤上存儲爲3個文件：
- table_name.frm(表定義)
- table_name.MYD(表數據)
- table_name.MYI(表索引)
由於數據和索引可以存放在不同的目錄，所以可以獲得更快的速度（平均分佈IO）。
InnoDB
InnoDB提供了具有提交、回滾和崩潰恢復能力的事務安全，使用了行級鎖，因此鎖衝突較MyISAM小很多。但是InnoDB寫的處理效率較差，並且佔用更多的磁盤空間保留數據和索引。
- 外鍵約束：MySQL支持外鍵約束的存儲引擎只有InnoDB，在創建外鍵的時候，要求父表必須有對應的索引，子表在創建外鍵的時候也會自動創建對用的索引。
- 存儲方式：
使用共享表空間：表結構在.frm中，數據在innodb_data_home_dir中，索引在innodb_data_file_path定義的表空間中。
使用多表空間存儲：表的表結構仍然在.frm中，但是每一個表的數據和索引分開放在.ibd中。
選擇合適的存儲引擎
MyISAM：默認的插件式引擎。如果應用是以讀、寫操作爲主，更新和刪除操作爲輔，對事物的完整性和併發性要求不高，那麼是非常合適的，如WEB、數據倉庫等應用環境下。
InnoDB：用於事務處理應用程序，支持外鍵。如果應用對事務完整性有比較高的要求，併發條件下需要數據的一致性，除了數據的讀、寫以外還有大量的刪除更新操作，那麼InnoDB是更加合適的引擎。InnoDB有效降低刪除和更新帶來的鎖定，還可以確保事務的完整提交和回滾。對於類似財務系統和計費系統，InnoDB是不二之選。