python3 通過 pybind11 使用Eigen加速

 

 

python是很容易上手的編程語言,但是有些時候使用python編寫的程序並不能保證其運行速度(例如:while 和 for),這個時候我們就需要藉助c++等爲我們的代碼提速。下面是我使用pybind11調用c++的Eigen庫的簡單介紹:

第一步:準備系統和IDE:

  • Windows 10 
  • vs2015 (用於調試c++代碼)
  • vscode (調試python代碼)

第二步:python虛擬環境:

1.創建虛擬python虛擬環境: 在vscode的terminal中執行  

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python -m venv env

2.下載  Eigen : 將Eigen解壓到當前目錄命名爲 eigen-3.3.8

3.在vscode的terminal中激活虛擬環境:

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./env/Scripts/Activate.ps1

4.安裝pybind11: 

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pip install pybind11

安裝numpy==1.19.3(使用1.19.4可能會有問題) :

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pip install numpy==1.19.3

第三步:使用vs2015編寫cpp_python.cpp, 並保證沒有bug

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#include <Eigen/Dense>

using namespace std

using namespace Eigen

MatrixXd add_mat(MatrixXd A_mat, MatrixXd B_mat)

{

  return A_mat + B_mat;

}

第四步:使用pybind11爲cpp_python.cpp添加python接口

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// cpp_python.cpp : 此文件包含 "main" 函數。程序執行將在此處開始並結束。

//

#include <pybind11/pybind11.h>

#include <pybind11/eigen.h>

#include<pybind11/numpy.h>

#include<fstream>

#include<iostream>

#include <Eigen/Dense>

using namespace std;

using namespace Eigen;

 

MatrixXd add_mat(MatrixXd A_mat, MatrixXd B_mat)

{

    return A_mat + B_mat;

}

 

namespace py = pybind11;

PYBIND11_MODULE(add_mat_moudle, m)

{

    m.doc() = "Matrix add";//解釋說明

    m.def("mat_add_py"/*在pyhon中使用的函數名*/, &add_mat);

}

第五步:設置setup.py用來編譯c++代碼

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from setuptools import setup

from setuptools import Extension

 

add_mat_module = Extension(name='add_mat_moudle', # 模塊名稱

              sources=['cpp_python.cpp'],  # 源碼

              include_dirs=[r'.\eigen-3.3.8',

                    r'.\env\Scripts',   # 依賴的第三方庫的頭文件

                     r'.\env\Lib\site-packages\pybind11\include']

              )

 

setup(ext_modules=[add_mat_module])

第六步:編譯測試

這是我當前的工作目錄

注意:我的cpp_python.cpp和setup.py是在同一個文件夾下。

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執行: "python .\setup.py build_ext --inplace"就會得下面的結果,生成.pyd文件表明我們已經編譯成功。

運行測試:

到此這篇關於python3 通過 pybind11 使用Eigen加速代碼的步驟詳解的文章就介紹到這了,更多相關python3 pybind1

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