Norman Matloff 和PeteSalzman在其著作《TheArt of Debugging, withGDB,DDD,Eclipse》中曾說過，確認原則是調試的本質。程序員編寫程序是爲實現特定目的，而一個程序可以由許多目的組成，調試是確認某些目的是否達到了，如果未能達到目的，那麼便可通過在調試中查看變量，發現問題癥結，進而解決問題。
在R中進行debug有幾種不同方式，你如果使用諸如Rstudio等圖形軟件，調試代碼很容易，所有的調試都在圖形界面下完成，你只需要根據需求在圖形界面下點擊相應選項來進行斷點設置、單步執行、查看變量等操作，查找問題癥結。但如果在命令行界面下調試R代碼，那就得要藉助於一些特別的調試工具。R的基礎軟件包base中包含了一些基本的調試工具，當然CRAN中也有一些其它優秀的調試工具。
對於一般用戶來說，掌握base中的基本調試工具就能滿足大部分需求，下面介紹R基本軟件包base中的調試工具的使用方法(也包含setBreakpoint(),其位於utils包中)。
由於在啓動和關閉調試中需要用到部分調試命令，這裏就先介紹進入調試模式後需要用到的一些基本命令。
1.基本調試命令
在進入dedbug調試狀態後，命令提示符從>變爲Browse[d]>(d表示函數調用鏈的深度)，可以通過一些基本的命令來進行控制:
n(表示next): 告訴R執行下一行代碼，並且執行完後馬上暫停,實際就是一行一行地執行代碼。相當於C語言開發工具Turbo C中的trace into。
c(表示continue):表示會執行若干條語句。若當前處在循環中，這一步會執行完整個循環，若當前處在函數內但又不再循環中，則會執行完當前函數。相當於C語言開發工具Turbo C中的step over。
where: 輸出一份棧跟蹤路徑，顯示到達當前位置的過程中函數的調用序列。
Q: 退出brower，返回R的主交互模式。
任意R命令: 即使在調試狀態browser中，依然處於R的交互模式中，所以你可以用任意R命令。
2啓動和關閉調試
R的核心調試工具由browser構成，通過browser，你可以逐行運行代碼，並在運行過程中進行檢查，查看變量。在調試代碼時，我們首先要讓程序進入調試狀態，有下列幾種方式可以實現。
2.1 在代碼中的指定位置加入browser()
開啓調試:
在R源文件中的指定位置插入函數browser()，保存源文件，運行源程序，程序一旦運行到browser()處，將會自動進入debug狀態。
取消調試:
但當用戶完成調試後，需要手動刪除源文件中的browser()函數，否則每次運行到browser()位置都會進入debug狀態。
temp_test.R:
(PS:此文件在下面會多次用到，所以貼出來，但後續用到時已經刪除了browser())
countsum <- function(count)
{
sum <- 0
for (i in 1:count)
{
sum <- sum + i
}
browser()
return (sum)
}
results <- countsum(100)
print(results)
運行之後:
> source("temp_test.R")
Called from: countsum(100)
Browse[1]>
2.2調用debug()
R的調試工具是針對單個函數的，由於擁有函數式編程的特性，R的每一個運算符，實際上也是函數(關於R函數，可參考這裏)，這裏所說的函數不包括一般的運算符。
開啓調試:
執行命令debug(fun)
fun指函數名，這樣每次調用函數fun()都會進入調試狀態。
取消調試:
執行命令undebug(fun)
再次調用函數fun()將不會進入調試狀態。
如下例所示:
> source("temp_test.R")
[1] 5050
> debug(countsum)
> countsum(10)
debugging in: countsum(10)
debug at temp_test.R#1: {
sum <- 0
for (i in 1:count) {
sum <- sum + i
}
return(sum)
}
Browse[2]> n
debug at temp_test.R#2: sum <- 0
Browse[2]> n
debug at temp_test.R#3: for (i in 1:count) {
sum <- sum + i
}
Browse[2]> sum
[1] 0
Browse[2]> c
exiting from: countsum(10)
[1] 55
2.3調用debugonce()
同debug()的調用方式一樣，區別在於:debugonce()只會在設置之後的第一次調用時進入調試狀態且只只進入一次，而debug()可以進入無限多次直到通過undebug()取消調試。
2.4用函數trace()進行跟蹤
trace(fun,tracer)
fun表示需要跟蹤或者取消跟蹤的函數名;racer表示跟蹤的對象，可以是某個函數，也可以是函數中的某個表達式。
開啓調試:
執行命令trace(fun,tracer)
每次調用函數fun()，都會顯示錶達式的值，或者對函數進行某些操作。
取消調試:
執行命令untrace(fun)
取消對某個函數的跟蹤。
如下例所示:
> source("temp_test.R")
[1] 5050
> trace(countsum,sum)
[1] "countsum"
> countsum(10)
Tracing countsum(10) on entry
[1] 55
> untrace(countsum)
> trace(countsum,browser())
Called from:methods::.TraceWithMethods(countsum, browser(), where =<environment>)
Browse[1]> Q
> rm(list = ls())
> source("temp_test.R")
[1] 5050
> trace(countsum,sum)
[1] "countsum"
> countsum(10)
Tracing countsum(10) on entry
[1] 55
> untrace(countsum)
> trace(countsum,browser)
[1] "countsum"
> countsum(20)
Tracing countsum(20) on entry
Called from: eval(expr, envir, enclos)
Browse[1]> n
debug: {
sum <- 0
for (i in 1:count) {
sum <- sum + i
}
return(sum)
}
Browse[2]> c
[1] 210
2.5.設置斷點setBreakpoint()
setBreakpoint()位於utils包中，R版本需要>=2.10
setBreakpoint(filename,linenumber)
表示會在源文件filename的第linenumber行設置斷點，但是實際上是通過函數來進行設置的，這點需要注意，即只有所設置的斷點處於文件中的某個函數內纔是有效的。此函數可以用在debug調試狀態中，在單步調試過程中，當設置了斷點後，可以讓程序直接運行到到斷點處，這在調試過程中很有用處。
開啓調試:
執行命令setBreakpoint(filename,linenumber)
然後再執行代碼，當代碼運行到斷點處即進入調試狀態。
取消調試:
執行命令untrace(fun)
fun表示函數名，Breakpoint要設在函數內纔有效，所以應當通過函數來取消斷點，setBreakpoint()是通過調用trace()發揮作用的。
如下例所示:
>source("temp_test.R")
[1]5050
>setBreakpoint("temp_test.R",3)
/home/sheng/WinD/test/temp_test.R#3:
countsumstep 3 in <environment: R_GlobalEnv>
>countsum(20)
temp_test.R#3
Calledfrom: countsum(20)
Browse[1]>n
debug:for (i in 1:count) {
sum<- sum + i
}
Browse[2]>where
where1: countsum(20)
Browse[2]>sum
[1]0
Browse[2]>c
[1]210
參考:
[1] Norman Matloff著，陳堰平等譯.R語言編程藝術.機械工業出版社,2013-05
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