KEGG 下載 Pathway 通路數據

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  • 這裏以小鼠爲例,點擊Ctrl+F查找物種小鼠的拉丁名Mus musculus

    這裏也可以用mouse來搜索,不過可以看到在kegg中含有三種鼠的信息。爲了信息準確,最好使用拉丁名作爲搜索條件。

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  • 點擊Brite hierarchy

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  • 進入KEGG Orthology (KO)

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  • KEGG Orthology 提供了兩種可供下載的格式,比如下載htext格式

    如果提示連接不到網絡,可以多次點擊,國外網的原因。。。

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  • htext格式如下

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  • 下載json格式

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  • json格式如下,這種格式更適合提取數據

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