今天分享的是CMAQ-5.2的安裝，首先陳述一下依賴庫的環境：
①ioapi-3.2
②openmpi-1.4.3-intell11.1
③netcdf-4.0.1（netcdf4.2之前的版本還沒有分成C庫和fortran庫分別安裝編譯）上述軟件是提前安裝好的，由於今天的主題是CMAQ安裝，所以這裏對上述三個依賴軟件安裝不做贅述，之後會單獨介紹。
接下來是從CMAQ官網下載CMAQ-5.2.zip，下載過程不穩定，確保網絡通常，最好連接外網VPN。下面開始安裝過程：
（1）把安裝包放在Linux系統中你期望的位置開始解壓
unzip CMAQ-5.2.zip
（2）解壓完成出現CMAQ-5.2文件夾，進入該文件夾
cd CMAQ-5.2
（3）打開bldit_project.csh，將CMAQ_HOME設置爲你的CMAQ-5.2文件夾所在的路徑即可，然後保存退出
vi bldit_project.csh
（4）運行bldit_project.csh腳本，初始化環境，生成data和lib空文件夾，如圖所示
./bldit_project.csh
（5）打開config_cmaq.csh，在自己系統所使用的編譯器下面修改編譯配置
vi config_cmaq.csh
我這裏用的intel編譯器，所以在intel下面修改，根據藍色提示文字進行修改，修改結果如圖所示：
IOAPI_MOD_DIR：ioapi的模塊文件路徑，即lib文件夾的路徑；
IOAPI_INCL_DIR：ioapi的include文件夾的路徑
IOAPI_LIB_DIR：ioapi的lib文件夾的路徑
NETCDF_LIB_DIR：netcdf的lib文件夾的路徑
NETCDF_INCL_DIR：netcdf的include文件夾的路徑
MPI_LIB_DIR：openmpi的lib文件夾的路徑
myFC："mpif90"，使用的Fortran編譯器的語法規範
myLINK_FLAG："-openmp"（如果是gfortran編譯器，則爲-gopenmp）
註釋掉setenv extra_lib "-lcurl"，取消setenv extra_lib ""的註釋
mpi_lib： "-lmpi"（mpich選擇-lmpich，openmpi選擇-lmpi）
在I/O API，netCDF，and MPI libraries下面修改netcdf_lib："-lnetcdf"（"-lnetcdf -lnetcdff"爲netcdf-4.2版本及其之後的版本）。修改完之後保存退出，並且運行config_cmaq.csh腳本，會在lib文件夾中自動創建鏈接，打開查看是否正確創建鏈接，如圖所示，如果文件夾湖藍色或者藍色，則爲正確，閃爍紅色及存在問題。
./config_cmaq.csh intel
（6）打開CCTM文件夾，進入scripts文件夾，運行bldit_cctm.csh
cd CCTM/scripts
./bldit_cctm.csh intel
cd BLD_CCTM_v52_intel
ls *exe
如果上述步驟都正確，則會生成BLD_CCTM_v52_intel文件夾，在該文件夾中存在CCTM_v52.exe可執行程序，如果沒有生成可執行程序，則需要根據運行bldit_cctm.csh中的報錯信息進行相關調整。
至此CMAQ-5.2安裝成功，接下來進行測試數據的運行：
（1）首先解壓測試輸入數據，將得到的文件夾移動至data文件夾
tar -xvf CMAQv5.2_Benchmark_SingleDay_Input_09_12_2017.tar.gz
mv SE52BENCH CMAQ-5.2/data
（2）進入CCTM/scripts，打開run_cctm.csh腳本，修改運行配置
cd CCTM/scripts
vi run_cctm.csh
設置運行方式PROC（serial串行，mpi並行），如果是並行，可以修改@NPCOL和@NPROW，兩者乘積爲並行所調用的總核數，根據自己的系統配置修改。這裏選擇的是mpi並行運行。然後註釋掉limit行，設置MPI=openmpi的bin文件夾路徑，設置MPIRUN=$MPI/mpirun，刪除time mpirun -r ssh -np $NPROCS $BLD/$EXEC中的-r ssh部分，如下圖所示。修改完之後保存退出，然後運行run_cctm.csh腳本，運行時間較長，適合提交作業後臺運行。
運行完成後在data文件夾會生成相應的output文件夾，進入查看LOGS，分別查看日誌文件，均顯示Program completed successfully字樣，如圖所示即爲運行成功。之後可以下載官網提供的測試輸出數據進行比對，確認結果相差無幾，那麼CMAQ就可以在你的系統上正確運行啦！
