原创 File::Basename module
File:Basename module =1= use File::Basename; =2= use File::Basename qw/basename, dirname, fileparse/ =3= use File
原创 Advanced Bash-Scripting Guide:
Appendix L. Sample .bashrc and .bash_profile Files The ~/.bashrc file determines the behavior of interactive shells. A
原创 linux下bashrc配置
#=====================================================# #-------------------------------------- # 如果有源代碼的全局定義, 請在此處定義.
原创 soap2結果分析
soap的結果分析: 1) id of read 2) full sequence of read. the read will be converted to the complementary if mapped
原创 統計學習方法
主要內容: 1、統計學習是關於計算機基於數據構建概率統計模型並運用模型對數據進行分析與預測的一門科學。統計學習包括監督學習、非監督學習和強化學習。 2、統計學習方法三要素---模型、策略、算法,對理解統計學習方法起到提綱挈領的作用。 3、
原创 A Simple Example of Dynamic Programming using perl scripts
【備註】:借鑑《Introduction of Algorithm》seconde edition第十五章的內容,可以在書上找到原實例。 1、概念和意義: 動態規劃(dynamic programming)是通過組合子問題的解而解決整個
原创 科技論文寫法
英文科技論文寫作是進行國際學術交流必需的技能。一般而言,發表在專業英語期刊上的科技論文在文章結構和文字表達上都有其特定的格式和規定,只有嚴格遵循國際標準和相應刊物的規定,才能提高所投稿件的錄用率。 撰寫英文科技論文的第一步就是推敲結
原创 R語言學習
1、rm ( list = ls() ) 清除內存中所有的變量,不再佔用內存。 2、ctrl L 清屏命令。清除屏幕上所有的內容。 3、rm( object ) 清除某個變量,一定要用括號,否則報錯。 4、.packages(al
原创 Interpreted Languages: Perl, PHP, Python, Ruby (Sheet One)
文章來自於:http://hyperpolyglot.org/scripting a side-by-side reference sheet sheet one: grammar and invocation | va
原创 blastall commands analysis
Blast,全稱Basic Local Alignment Search Tool,即“基於局部比對算法的搜索工具”,由Altschul等人於1990年發佈。Blast能夠實現比較兩端核酸或者蛋白序列之間的同源性的功能,它能夠快速的找到兩
原创 blat analysis
usage: blat database query [-ooc=11.ooc] output.psl where: database and query are each either a .fa , .nib or
原创 數組和哈希的數值排序問題(sort)
在perl中對數組或者散列進行排序的工具是sort,在這兒,一般分爲兩種,字符串和數值(阿拉伯數字)排序問題,sort默認的情況是使用Ascall碼排序。 1、sort format >> sort USERSUB LIST >>
原创 子過程實踐
1。數組輸入到子過程的是數組存儲第一個元素的地址。也就是說不論原始數組中有多少元素,輸入的@_中只有一個元素,首地址。接受首地址的變量必須是加括號的比如"($aa)"不能是“$aa"。 而且遍歷@_是沒有任何意義的(其中只有一個元素,首地
原创 paste and join (Linux)
paste格式: paste -d -s file1 file2 paste將按行將不同文件行信息放在一行。缺省情況下,paste連接時,用空格或tab鍵分割新行中不同文件,但是可以用-d來指定分隔符。 選項含義如下: -d 指定不