原创 Vaa3D_SD、SSD指標的來源

之前寫了一個博客是matlab計算SD和SSD的,但是沒有具體的介紹指標的由來。 https://blog.csdn.net/jujiyu6446/article/details/102924301 這兩個指標是來自於 Peng

原创 Vaa3D_windows基於MATLAB批量運行插件_輸入多組圖片_FMST_MOST_ENT

文章目錄APP2BUJT_fastmarching_spanningtreerun_BUJT_FMST.mparafunc_BUJT_FMST.mENTparafunc_ENTrun_ENT.mMOSTparafunc_MOSTr

原创 vaa3d_神經元追蹤算法介紹之TReMAP_neuron tracing

主要內容 Zhou Z, Liu X, Long B, et al. TReMAP: automatic 3D neuron reconstruction based on tracing, reverse mapping an

原创 HDU-1005 Number Sequence(錯誤驗證集)

http://acm.hdu.edu.cn/showproblem.php?pid=1005 1 1 49 以下是前18項 可以手算驗證 從第17項開始循環,循環的mod是16 1 1 2 3 5

原创 DIADEM_metric不能運行及解決辦法

有的時候運行DIADEM metric這個評價指標的時候會報錯,報錯的形式如下圖所示,會提示在哪一行有錯誤,比如這個案例中說的是17行有錯,然後發現問題在於17行的type爲負數,沒有辦法處理。 java.util.zip.Dat

原创 Vaa3D_批量運行插件方法

1.首先通過這個瞭解如何通過控制檯命令行調用V3D程序 https://blog.csdn.net/jujiyu6446/article/details/92843403?tdsourcetag=s_pctim_aiomsg 2.

原创 Qt4程序打包_包含MySql數據庫情況下

程序編譯完成後,從對應編譯模式下的文件夾下,複製生成的exe至一個新的文件夾,找到qt安裝路徑下的以下dll 以下爲debug模式下的打包,因此dll大多是帶有d的。 libmysql.dll 是編譯mysql是獲取的。 如有其

原创 matlab讀取、寫入和鏡像三維圖像棧tif文件

matlab讀取的tif文件與v3d讀取的tif文件似乎有個上下顛倒請注意 讀取tiff文件 fname='*.tif'; info = imfinfo(fname); num_images = numel(info); for

原创 Vaa3D並行程序測試-OPENMP-VS2010-加速程序

首先,我能確定的是該OPENMP測試程序通過Qt自帶的MINGW編譯器直接編譯有效,但是我沒有對VS編譯器進行測試,究竟有沒有提升,提升了多少我沒有進行測試,因爲普通的垃圾代碼會被VS優化。 首先是pro文件 QMAKE_CXXF

原创 Vaa3d_修改生成的dll名_pro文件

1.創建插件 運行V3D–Plug-in–_Vaa3D_plugin_creator–create plugin 2.選定保存路徑 更改 Save Folder,一般保存到 D:\V3D\vaa3d_tools\hackat

原创 vaa3d_神經元追蹤算法介紹之MOST_neuron tracing

Rapid Reconstruction of 3D Neuronal Morphology from Light Microscopy Images with Augmented Rayburst Sampling Ming X

原创 vaa3d_神經元追蹤算法介紹之半自動追蹤算法_neuron tracing

介紹一篇半自動追蹤算法 Zandt B J , Losneg?Rd A , Hodneland E , et al. Semi-automatic 3D morphological reconstruction of neuro

原创 Vaa3d_刪除plugins下非dll文件和空白文件夾_matlab

警告!!!刪除操作不可逆請謹慎操作 在該代碼中我已經註釋了刪除代碼,如需要刪除請自行解除註釋。 可能在刪除空白文件夾後生成新的空白文件夾,因爲該文件可運行數次以確認刪除完畢。 該功能非必須!請注意! 原因 第一 在windows下

原创 Matlab_按順序讀取多個tif文件後轉化爲三維圖像棧

多個JPG文件或者tif文件都行 close all clear suffix='.tif'; imgFolder='D:\dateset\DIADEM\Olfactory Projection Fibers\Image Stac

原创 vaa3d_神經元追蹤算法介紹之APP2_neuron tracing

APP2 Xiao, H. and Peng, H. (2013) APP2: automatic tracing of 3D neuron morphology based on hierarchical pruning of